中国科学技术大学本科生院成立于2020年5月7日，是学校深化本科教育教学改革、进一步整合本科教育资源、优化本科教育教学管理模式、健全本科人才培养体制、保障本科教育全过程高效协调发展的重大举措。其目的是建立本科教育教学质量管理的长效机制，变多部门分散决策为统一高效管理，增强面向师生的教学服务功能，构建一个科学高效的本科教育教学管理常设机构。

本科生院的主要职责：本科生思政教育；本科生综合素养提升；本科生创新创业能力培养；本科教学运转与日常教学事务；本科招生和就业服务；本科教育研究、改革与发展；本科教学条件保障与质量监控。

本科生院作为议事协调机构，负责统筹教务处、学生工作部、团委、招生就业处、保卫与校园管理处、创新创业学院、书院、公共教学部等，系统规划、全面指导和充分协调涵盖“第一课堂”和“第二课堂”的本科教育教学工作。

院务委员会（党政联席会议）为本科生院最高决策机构，由本科生院院长、副院长，相关部门负责人组成，负责本科生院重大事项的决策和协调。